Saint-Esteben / Donoztiri fait partie de la vallée de l’Arbéroue du nom de la rivière qui la traverse.
Cette dernière est alimentée par deux sources principales, celle d’Eiheraldia à Helette et celle d’Uhaldegaraia à St Esteben. L'arberoue longe le flanc ouest du massif Eltzarruze-Lerdatze-Latxapuru, poursuit sur St Martin d’Arberoue où elle traverse de part en part la colline du Gaztelu où se trouvent les grottes d’Isturits, Otsozelaia et Erberua, ressort à Isturits, continue sur Ayherre, La Bastide Clairence, Oregue pour se mêler ensuite au Lihoury (en provenance d’Iholdy) à Bardos, rejoindre la Bidouze à Bidache puis l’Adour à Guiche.
Si l’Arberoue est le principal cours d’eau de St Esteben, Garraldako Erreka draine quant à lui la partie ouest de la commune pour rejoindre ensuite l’Aran (surnommée La Joyeuse) en provenance du Baigura (Helette).
La superficie de la commune est de 1371 hectares.
Son point culminant est le mont Garralda (465 m), son point le plus bas est à 118 m.